Все настройки сервера по умолчанию вы можете посмотреть в файле phpinfo.
Большинство настроек вы можете поменять самостоятельно на собственном аккаунте, используя файлы php.ini и .htaccsess.

2. Как выложить сайт на хостинг? В какую папку? Что делать если у меня несколько сайтов?
В ваше корневом каталоге находится папка public_html. Именно в нее нужно выкладывать файл index и все др. файлы и папки вашего сайта.
То что вы туда выложите будет отображаться так:
www. ваш_домен/файл1, www. ваш_домен/файл2 и т.д.

Если вы создадите в public_html папку, то она станет поддиректорией вашего сайта, а ее содержимое будет отображаться так: www. ваш_домен/новая_папка/файлы_папки.

После добавления на аккаунт нового домена (кнопка Дополнительные домены в CPanel), в директории public_html появится его папка. Все что вы туда выложите будет иметь внутренний путь: public_html/новый_домен/его_файлы. А через браузер будет иметь вид: www. ваш_новый_домен/файлы.

3. Как с помощь CPanel создать базу данных, почтовую ячейку, поддомен и т.д.?
Верхней части CPanel есть раздел, который называется Video Tutorials. Это обучающие видео-ролики, в которых по пунктам показывается необходимая последовательность для выполнения той или иной операции.

Как создать php.ini.

Запустите Notepad (не Word, не WordPad, а Notepad) menu Start –> Programs -> Accessories -> Notepad.

Создайте текстовый файл, впишите в него необходимые настройки (синтаксис записи - очень прост) вида ‘директива’ = ‘значение’. Например, register_globals = On если нужно включить или register_globals = Off, если нужно выключить, или например, safe_mode = On.

Сохраните файл с именем php.ini. Для этого в момент сохранения в окошке Notepad где вы пишите имя файла (php.ini) строчкой ниже выберите из выпадающего списка «все файлы» и нажмите Ok. Выложите php.ini в директорию, где должен работать ваш скрипт.

13. Как сменить права (permissions) у файла/папки? Какие права/атрибуты нужно выставлять?
В ftp-клиенте (например, FileZilla) щелкните правой кнопкой на папке или файле и в появившемся менню выберите нижнюю строчку - "Атрибуты файла". В поле ввода укажите 755 (или другое) и нажмите Ок.

или

Для смены прав доступа папки ли файла, зайдите на cPanel. Откройте Файл Менеджер (File Manager), кликните на название нужной вам папки или файла. Справой стороны появится меню управления этой папкой или файлом. Кликните на ссылку Change Permissions. Измените права.

В общем случае, если не оговоренно другое, права (permissions) на папки нужно выставить 755, а на файлы - 644.
На файлы шаблона (имеют расширение .tpl) права нужно ставить 666.


14. Как включить на сервере поддержку php5?
Чтобы пееключить работу всего хостинг-аккаунта на php5 в CPanel нажмите на кнопку PHP Configuration и выберите требуемую версию. Учтите, что это сменит настройки версии php на всем вашем аккаунте.
Как сделать так, чтобы на одном хостинге один сайт работал на php4, а другой на php5?
По умолчанию на вашме аккаунте включен php4, но если вам в одной из папок нужно, чтобы работал php5, то тогда создайте файл с именем .htaccess, впишите туда строчку: 
AddHandler application/x-httpd-php5 .php
или
AddHandler application/x-httpd-php53 .php - для текущей версии 5.3.18
и положите в нужную папку.
Сайт, который будет находиться в этой папке будет работать на php5.

15. Можно ли вначале купить маленький тарифный план, а потом перейти на хостинг большего размера?
Да, можно.
Деньги оставшиеся за неиспользованное время на хостинге будут пересчитанны за хостинг большего размера. Вам нужно будет доплатить только разницу.

16. Как установить пароль на определенную папку?
Для того чтобы закрыть доступ на определенную директорию (папку), зайдите на cPanel.
В разделе “Инструменты управления сайтом” кликните на ссылку "Защите директорий", кликните на название нужной вам папки. В форме, на открывшейся странице, напишите название защищаемого ресурса, добавьте пользователя и пароль для него.

17. Что такое трафик и как он может закончиться?
Трафик (или еще называют «пропускная способность» - eng. bandwidth)  это количество информации, которое ваш сайт можете показать своим посетителям.  Рассмотрим на примере.
Допустим, что вес страницы вашего сайта, вместе с картинками, анимацией и текстом, составляет 1 МВ. Если на ваш сайт зашло 10 человек и загрузили эту страницу, то ваш сайт израсходовал 1 МВ х 10 человек = 10 МВ трафика.
Если зашло 300 чел/мес. и каждый загрузил только по одной странице, то трафика ушло 300 МВ, а если по 2 страницы, то 600 МВ.
Если же на вашем хостинг тарифе предусмотрен трафик только в 500 МВ/мес, то ваш хостинг аккаунт будет остановлен до конца месяца.
Первого числа следующего месяца трафик обнулится и у вас опять будет 500 МВ/мес.

18. Сайт работает не корректно. Как включить отображение ошибок php?
При отладке сайта, очень полезно получить все сообщения об ошибках. Для отображения ошибок PHP добавьте в файл php.ini:
display_errors = On
Внимание: Не надо задавать отображение ошибок через файл .htaccess - работать не будет.

19. После установки сайт выдает Error 500 - Internal Server Error.
Ошибка 500 "Internal Server Error", как правило, появляется в случае когда вы поместили неправильную инструкцию в файл .htaccess, или когда невозможно запустить скрипт, который вы разместили на сервере, или когда в скрипте есть ошибки. Это только несколько наиболее частых причин возникновения ошибки 500, хотя есть есть еще масса других.

Рассмотрим сначала случай, когда вы поместили некорректную инструкцию в файл .htaccess.
Даже, если на другом сервере (denver'e) все работает хорошо - на наших серверах php установлен, как suphp - это дает огромные преимущества в плане безопасности, но обязывает вас делать все записи касающиеся php не в .htaccess, а в php.ini.

Internal Server Error - вы так же получите, если вы ошиблись в написании названия нужной директивы или параметров к ней, в файле error.log вы найдете примерно такую ошибку:
[Wed Mar 16 18:18:48 2009] [alert] [client 217.16.16.16] /home/uXXXXX/aaa.ru/publik_html/.htaccess: Invalid command 'DrectoryIndex', perhaps mis-spelled or defined by a module not included in the server configuration
Веб-сервер укажет вам какую конкретно директиву он посчитал ошибочной - ее нужно будет исправить. В данном случае веб-сервер сообщил что директивы DrectoryIndex он не знает. И действительно - нет директивы DrectoryIndex, есть DirectoryIndex. Имеет место опечатка.

Если ошибка 500 возникает при обращении к скрипту на языке Perl, размещенному в каталоге cgi-bin, нужно проверить права доступа на этот скрипт. Права должны быть 755 (rwxrx-rx). Если это не так, нужно изменить права на 755 командой chmod 755 script.pl в unix shell или воспользоваться для этого FTP. Нужно отдельно отметить - права на скрипты должны быть установлены строго в 755.

Пожалуйста, проверьте правильный ли режим передачи файлов по FTP вы использовали при загрузке скрипта на наш сервер. Все скрипты, равно как и любые другие текстовые файлы, должны передаваться по FTP в текстовом (ASCII) режиме. Если же был использован двоичный (Binary) режим передачи файлов, скрипты наверняка работать не будут.

Если после проверки корректности установленных прав на файл скрипта ошибка не исчезла, нужно изучить последние записи в файле error.log - в него веб-сервер помещает все сообщения об ошибках. Так вы найдете строчку вида
[Sun Msr 19 17:15:39 2009] [error] [client 217.16.16.16] Premature end of script headers: /home/uXXXX/aaa.ru/cgi-bin/script.pl
Первое, что нужно сделать если вы получили такую ошибку, это проверить правильно ли скрипт выдает HTTP-заголовки. Каждый скрипт должен сначала печатать строку с указанием соответствующего Content-type и только потом непосредственно то, что увидит пользователь (например, HTML-код). Пример строки для выдачи заголовка обычного HTML-документа:
print "Content-type: text/html; charset=windows-1251\n\n";
Если и после выдачи правильных заголовков ошибка 500 не исчезла, нужно проверить корректность работы скрипта в целом. Для этого нужно получить доступ в unix shell и далее выполнить команду проверки синтаксиса:
> perl -cw script.pl script.pl syntax OK
Если скрипт написан с ошибками, нужно будет исправить ошибки, руководствуясь соответствующей диагностикой, а также проверить синтаксис скрипта снова. .htaccess

20. Чем мне поможет файл .htaccess?
Файл .htaccess позволяет конфигурировать ваш хостинг аккаунт так, как будто у вас свой веб-сервер. Директивы, указанные в файле .htaccess, распространяются на ту директорию, в которой находится файл и на все вложенные директории, включая поддомены.

Чтобы создавать файл .htaccess - создайте файл .txt и замените его"окончание" на htaccess, а имя удалите. Вы получите .htaccess и можете его редактировать, как любой другой файл на вашем компьютере.

Внимание: Директивы, касающиеся настроек php нельзя писать в .htaccess. даже, если на другом сервере (denver'e) все работает хорошо - на наших серверах php установлен, как suphp - это дает огромные преимущества в плане безопасности, но обязывает вас делать все записи касающиеся php не в .htaccess, а в php.ini.

21. Как бороться с повышенных расходом трафика?
(Куда уходит трафик?)
Лишний трафик может уходить на поисковики, спам-бото-роботов и посетеителей.
Поисковики: Если ваш сайт ориентирован на США, а к вам ходят Яндекс с Рамблером, то трафик вы раздаете зря. И наоборот, если основные клиенты в России, то доступ для Altavista, Bing, AOL и проч. должен быть закрыт.
Спам-бото-роботы: Если в Cpanel -> AWStats вы видите, что с определенного IP было скачано много MB, то почти наверняка это бот и этот IP лучше закрыть через .htaccess.
Посетители: Отсекайте нерелевантных посетителей из тех стран из которых вы никогда не получите заказов. Сайт на русском, не может быть востребован посетителми из Венесуэлы. Если в Cpanel -> AWStats вы видите нерелевантные страны, то закройте их через .htaccess.
Можно использовать этот скрипт: ipinfodb.com/ip_country_block_htaccess.php

На сервере УЖЕ ЗАБЛОКИРОВАНЫ: EG, DZ, MA, IQ, SD, SA, YE, SY, TN, SO, AE, LY, LB, OM, KW, QA, BH, BR, SE, VN, PK, IN, MX, KP, DO, MY, PH, IR, CH - БЛОКИРОВАТЬ ИХ НА УРОВНЕ АККАУНТА НЕ НУЖНО.
Посмотреть буквенные коды страны можно тут.